武承嗣当上宰相那年是如意元年。那一年，李昭德奉命负责营建洛阳作为第二个都城，得知武承嗣被任命为文昌左相，他不顾工作繁忙，立即劝谏武则天。李昭德反对的理由是担心武承嗣篡夺皇权——自古帝王，父子之间犹相篡夺权力，何况姑侄？
武则天觉得这话有道理，到时候武承嗣那小子如果真来争权，如何打算？便罢了武承嗣的宰相职务，给了他一个太子少保的虚衔，任命李昭德为宰相，拜他为凤阁侍郎、同平章事。
李昭德之所以极力阻挠武承嗣担任宰相，也是他“力保李唐宗室”的体现。因为武承嗣这个家伙，在此之前就对李唐宗室恨之入骨，在武则天还是太后的时候，就建议武则天大杀功臣，并且把杀害李唐宗室作为重点——去唐家子孙，诛大臣不附者。
武承嗣和堂弟武三思，首先把李渊的儿子韩王李元嘉、鲁王李灵夔等，作为必欲除掉的目标，多次请求武则天杀掉他们，理由是他们“属尊位重”。
垂拱四年，武承嗣和武三思诬告李元嘉谋反，李元嘉被迫令自杀；同年，李灵夔反对武则天篡权被流放岭南，途中自杀。
仅在垂拱四年杀掉的李唐诸王，就包括越王李贞、琅琊王李冲、韩王李元嘉、鲁王李灵夔等。
公元690年7月，武承嗣又唆使酷吏周兴，诬告唐高宗李治之子泽王李上金、许王李素节谋反，押解途中派人缢杀李素节，李上金自杀；同年8月，南安王李颖等李唐宗室12人，也惨遭杀害。到此为止，李唐宗室几乎被杀光，武承嗣仍不罢休，又劝武则天杀掉李孝逸、韦方质等许多大臣，理由是他们的声望甚高，又不曲事武氏。